第三世界的外星人想要侵略地球，于是他们创造了机械哥吉拉来作为他们侵略地球的武器，可是地球的英雄哥吉拉以及传说中的守护神西撒王，为了地球人的和平及安全，勇敢的对抗恶势力。哥吉拉终于不负人类的期望，摧了机

接續前作“哥吉拉X機械哥吉拉”的故事，一年前與哥吉拉（Godzilla）的決戰，機龍（機械哥吉拉Mechagodzilla）受損程度37%，失去了右腕及終極武器-絕對零度炮。維修組員中條義人在八王子基