进入了明治时代，曾经的“刽子手拔刀斋”绯村剑心（佐藤健 饰）已经习惯了神谷道场的安宁生活谁知就在这一天，倒幕战争时的旧友――号称维新三杰之一的大久保利通（宫泽和史 饰）将其请去原来继承了剑心刽子手身份

为了救神谷薰（武井? 饰），绯村剑心（佐藤健 饰）纵身跃入大海，昏迷中他飘到某座小岛，最终为传授了他飞天御剑流的师父比古清十郎（福山雅治 饰）所救深感到自身与志志雄真实（藤原龙也 饰）的巨大差距，为了